Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp20Q8C6M1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp20Q8C6M1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp20Q8C6M1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp20Q8C6M1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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