Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4933409G03RikQ8C5U0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms