Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 CT009721.1-201ENSMUST00000213590 770 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trim35Q8C006 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trim35Q8C006 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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