Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TnrQ8BYI9 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms