Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms