Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbfox3Q8BIF2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbfox3Q8BIF2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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