Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms