Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ubash3bQ8BGG7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ubash3bQ8BGG7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ubash3bQ8BGG7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ubash3bQ8BGG7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ubash3bQ8BGG7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ubash3bQ8BGG7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ubash3bQ8BGG7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms