Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pcsk9Q80W65 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pcsk9Q80W65 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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