Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ube3cQ80U95 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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