Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Clec18aQ7TSQ1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Clec18aQ7TSQ1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Clec18aQ7TSQ1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Clec18aQ7TSQ1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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