Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms