Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp3Q7TNH6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms