Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Topbp1Q6ZQF0 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms