Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nup98Q6PFD9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nup98Q6PFD9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nup98Q6PFD9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup98Q6PFD9 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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