Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms