Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nop58Q6DFW4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nop58Q6DFW4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nop58Q6DFW4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nop58Q6DFW4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms