Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms