Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ric1Q69ZJ7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms