Protein–RNA interactions for Protein: Q692V3

Ttc41, Tetratricopeptide repeat protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc41Q692V3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc41Q692V3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc41Q692V3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms