Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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