Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltcQ68FD5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms