Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox19Q62249 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox19Q62249 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms