Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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