Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Usf1Q61069 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Usf1Q61069 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Usf1Q61069 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms