Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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