Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trim38Q5SZ99 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim38Q5SZ99 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim38Q5SZ99 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim38Q5SZ99 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim38Q5SZ99 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim38Q5SZ99 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim38Q5SZ99 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Trim38Q5SZ99 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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