Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tsr1Q5SWD9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms