Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms