Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms