Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Usp48Q3V0C5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp48Q3V0C5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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