Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capn13Q3UW68 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms