Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms