Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms