Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec31aQ3UPL0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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