Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms