Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Q3U6N9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Q3U6N9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U6N9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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