Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ulk3Q3U3Q1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ulk3Q3U3Q1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ulk3Q3U3Q1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ulk3Q3U3Q1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ulk3Q3U3Q1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ulk3Q3U3Q1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ulk3Q3U3Q1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ulk3Q3U3Q1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms