Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms