Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Usp39Q3TIX9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp39Q3TIX9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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