Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms