Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Prr27Q3SYJ2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prr27Q3SYJ2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prr27Q3SYJ2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prr27Q3SYJ2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Prr27Q3SYJ2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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