Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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