Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms