Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
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Rpusd3Q14AI6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms