Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms