Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Perm1Q149B8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms