Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Ttc39dQ0VF76 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc39dQ0VF76 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc39dQ0VF76 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc39dQ0VF76 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc39dQ0VF76 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc39dQ0VF76 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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