Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Plac8l1Q08EJ0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms