Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms